Skip to main content
SUPERVISOR
Majid Talebi,Badraldinebrahim Seyed tabatabaei,Mohammad Mehdi Majedi
مجید طالبی (استاد راهنما) بدرالدین ابراهیم سیدطباطبایی (استاد راهنما) محمد مهدی مجیدی (استاد مشاور)
 
STUDENT
Mohammad Beygi
محمد بیگی

FACULTY - DEPARTMENT

دانشکده کشاورزی
DEGREE
Master of Science (MSc)
YEAR
1391

TITLE

Assessment of Genetic Diversity among and within Iranian Sainfoin (Onobrychis vicifolia) Landraces using SRAP Marker
The Sainfoin ( Onobrychis vicifolia) is perennial herbs of the legume family ( Fabaceae ) and is one of the most important forage legumes. Iran is one of the most important centers for genetic diversity of onobrychis. Due to the fact that the sainfoin, as a forage crop, plays an important role in the poroduction of forage in Iran pastures, nevertheless, studies on sainfoin landraces in the country is limit and mainly has been made locally. Assessment of genetic diversity in different sainfoin landraces can keep these plant germplasm resources and contribute to effective correctional programs. Estimate of genetic diversity in the genetic composition of plants and also determines the relationship between species plays an important role in understanding and managing the natural variation within the plant species. The use of molecular markers can help to assessment of genetic variation in different sainfoin landraces. So, in this study, we used SRAP molecular marker as a simple, reliable, entire throughput of genome and targeting of coding secuences. For evaluation of genetic diversity among 17 different masses of onobrychis werw collected from different region of Iran. Genomic DNA was extracted from fresh leaf samples and PCR reaction performed following measurment of quality and quantity of extracted DNA. Out of 10 primer combinations, 88 bands was created, of which 73 (82.95?) were polymorphic. Average amount of PIC = 0.45 represents suitable power of SRAP marker to determine genetic diversity in sainfoin. In the assessment of genetic diversity among masses, the genetic distance among masses was studied between 0.124 and 0.349. In the provincial distribution of masses, the lowest and highest genetic distance was calculated between masses of Russia (P and Q cods) and Damavand and Najaf Abad regions (G and M cods), respectively. Numerical value of 1.33 obtained for gene flow between grouos (Nm) showed that there is gene flow in population but this current can not lead to homogenization of the population. The shanon information index was calculated for primer compositions between 0.31 and 0.52. In The cluster analysis of SRAP data, drawed dendogram with NTSYS-sp, Ver 2.02e could not classify masses in different groups. In other word, commixture of masses in the dendogram showed that there is not any genetic diversityamong species. Principal coordinate analysis (PCoA) of SRAP data showed that sum of first three PCs colud be represented 45.629 ? of the total variation; therfor, the cluster analysis is the best method for evaluation of genetic diversity aong sainfoin landraces. Key Words : SRAP, genetic diversity, sainfoin
اسپرس ( Onobrychis vicifolia, L) گیاهی چندساله و از خانواده بقولات بوده و ایران یکی از مهمترین مراکز تنوع جنس اسپرس به شمار می رود. با وجود اهمیت این گیاه در مراتع ایران، با این حال، تحقیقات بر روی توده های بومی اسپرس در کشور محدود و عمدتا به صورت منطقه ای صورت گرفته است. بررسی تنوع ژنتیکی توده های مختلف گیاه اسپرس می تواند در حفظ ذخایر ژرم پلاسم این گیاه و کمک به برنامه های اصلاحی موثر باشد. استفاده از نشانگرهای مولکولی می تواند در بررسی تنوع ژنتیکی توده های مختلف گیاه اسپرس کمک موثری نماید. بر همین اساس در این تحقیق ازنشانگر مولکولی SARP که ترکیبی از سادگی، قابلیت اطمینان بالا، پوشش متوسط سرتاسری ژنوم و با قابلیت تکثیر نواحی کد کننده در ژنوم است استفاده شد. تعداد 17 توده مختلف گیاه اسپرس متعلق به چهار گونه O.vicifolia (تعداد 13 توده)، O.vicifolia (تعداد یک توده)، O.vicifolia (تعداد یک توده) و O.vicifolia (تعداد یک توده) از مناطق مختلف کشور جمع hy;آوری گردید و پس از استخراج DNA از برگ تازه و تعیین کمیت و کیفیت، DNA استخراج شده در واکنش های PCR استفاده گردید. از مجموع 10 ترکیب آغازگری مورد استفاده 88 نوار حاصل شد که از این تعداد، 73 نوار (95/82 درصد) چندشکل بودند. میانگین مقدار 45/0 = PIC نشان دهنده قدرت مناسب نشانگر SRAP در بررسی تنوع ژنتیکی در گیاه اسپرس می باشد. در بررسی تنوع ژنتیکی بین توده ها، دامنه فاصله ژنتیکی بین توده های مورد مطالعه بین 124/0 و 349/0 بدست آمد. از نظر پراکنش استانی توده ها، کمترین فاصله ژنتیکی بین توده های مربوط به کشور روسیه (کدهای P و Q) و بیشترین فاصله ژنتیکی بین توده های مربوط به مناطق دماوند و نجف آباد (کدهای G و M) محاسبه گردید. مقدار عددی 33/1 بدست آمده برای جریان ژنی بین گروه ها (Nm) نشان داد که در جمعیت های مورد مطالعه جریان ژنی وجود دارد ولی این جریان تا حدی نیست که بتواند موجب همگن شدن جمعیت ها شود. دامنه میزان شاخص اطلاعات شانون برای ترکیبات آغازگری بین 31/0 تا 52/0 محاسبه گردید. در تجزیه خوشه ای داده هایSRAP، دندوگرام ترسیم شده با استفاده از نرم افزار NTSYS-sp, Ver 2.02e. نتوانست ژنوتیپ های مورد استفاده در این تحقیق را در گروه های جداگانه قرار دهد. به عبارت دیگر اختلاط توده ها در یکدیگر نشان دهنده تنوع ژنتیکی اندک بین توده ای می باشد. تجزیه هماهنگ اصلی نیز نشان داد که سه مولفه اول در مجموع 629/45 درصد از کل تغییرات را توجیه می کنند، بنابر این روش تجزیه خوشه ای به عنوان بهترین روش برای ارزیابی تنوع ژنتیکی بین توده های اسپرس با استفاده از داده های SRA می باشد. کلمات کلیدی : اسپرس، تنوع ژنتیکی، نشانگر SRAP، Onobrychis vicifolia

ارتقاء امنیت وب با وف بومی