Skip to main content
SUPERVISOR
Majid Talebi,Sayedamirhossein Mahdavi,Mohammad ali Edriss,Hamid reza Rahmani
مجید طالبی (استاد مشاور) سیدامیرحسین مهدوی (استاد راهنما) محمدعلی ادریس (استاد راهنما) حمیدرضا رحمانی (استاد مشاور)
 
STUDENT
Razieh Nori
راضیه نوری

FACULTY - DEPARTMENT

دانشکده کشاورزی
DEGREE
Master of Science (MSc)
YEAR
1389
Because of the TLR4 polymorphism on the milk trait has been proven, this study was to assess the frequency of TLR4 T4CRBR2 polymorphism in Iranian Holestein dairy cows. In addition, the other aim in this study was estimating the association between the TLR4 T4CRBR2 and productive trait performance of milk as well as somatic cell score of milk (SCS) in this population. The gene toll like receptor 4 (TLR4) had been mapped to the bovin BTA8 and encodes the TLR4 receptor. The considered polymorphism results from C à T nucleotide substitution in TLR4 gene exone 3 and so, teronine to isolusine of amino acid change in product protein. This polymorphism proved to significantly affect the percentage milk productin.TLR4 gene was studied in this population (400 cows) by PCR-RFLP technique. The 382 bp fragment including the considered polymorphism was amplified and digested with enzyme ALU1 to determine the genotypes of 400 Holstein cows. Both alleles A and B were detected after digested by the restrictive enzyme. AA individuals have not mutant alleles, AB individuals have one mutant allele and BB individuals have two mutant alleles. Genetic analysis of the population was done by the software PopGen32. Frequency of genetic AA, AB and BB genotypes were respectively 0.1, 0.55 and 0.35 and frequency of A and B alleles were estimated 0.37 and 0.63, respectively. For the statistical analysis investigation relationship between TLR4 T4CRBR2 with productive traits of milk and somatic cell score of milk in first lactations, the software SAS,procedure GLM was used. In the analysis model the effects of genotype and combined effect of herd, year and season of parturition were considered as fixed effects and days in lactitation, open days and milk production were considered as covariables. The statistical analysis showed significant effects of the genotype for corrected fat percentage, milk breeding value, protein percentage and somatic cell score of milk traits but genotypes have not significant effect for fat breeding value. Estimated average effects of substituting the isoleusine for the tereonine variant on record corrected of milk production, dairly milk production average, fat percentage, protein percentage, somatic cell score of milk and on milk breeding value and fat breeding value. These results can be showed that allele B is effect on increase milk production and decrease fat of milk. The relatively hight frequency of the B allele than the A allele may be due to selection for milk yield in recent years. Results showed that the TLR4 T4CRBR2 polymorphism can be a source that underlies the reported quantitative trait loci for fat content trait in the proximal region of bovine chromosome 8. Keywords: TLR4 gene, Holstein cows, Genotype, Polymorphism
از آنجایی که تاثیر جایگاه T4CRBR2 پروتئین حاصل از ژن TLR4 بر روی تولید شیر به اثبات رسیده است، این مطالعه به ارزیابی فراوانی این چند شکلی در گاوهای هلشتاین پرداخت. بعلاوه هدف دیگر در این مطالعه تخمین ارتباط بین چند شکلی جایگاه T4CRBR2 ژن TLR4 با عملکرد صفات تولید شیر و همچنین امتیاز سلول های بدنی شیر در این جمعیت بود. ژن TLR4 روی کروموزوم 8 گاوی، نقشه یابی شده است و گیرنده TLR4 را کد می کند که در دفاع ذاتی در مقابل میکروب ها نقش دارد. چند شکلی مورد نظر از جایگزین شدن نوکلئوتید C بجای T در اگزون 3 ژن TLR4 ایجاد می شود. بنابراین باعث تغییر اسیدآمینه ترئونین به ایزولوسین در محصول پروتئینی ژن می شود. ژن TLR4 در جمعیت مورد نظر (400 گاو) توسط تکنیک PCR-RFLP مورد مطالعه قرار گرفت. یک قطعه 382 جفت بازی دارای چند شکلی مورد نظر تکثیر شد و با آنزیم ALU1 هضم گردید. هر دو آلل A و B در جمعیت مشاهده شد. سه نوع ژنوتیپ AA، AB و BB پس از هضم با آنزیم برشی تشخیص داده شد. افراد AA آلل جهش یافته نداشتند، افراد AB دارای یک آلل جهش یافته و افراد BB دارای دو آلل جهش یافته بودند. فراوانی ژنوتیپی AA، AB و BB به ترتیب 1/0، 55/0 و 35/0 و فراوانی آللی A و B به ترتیب 37/0 و 63/0 بود. بمنظور آنالیز آماری بین چند شکلی جایگاه T4CRBR2 ژن TLR4با صفات تولید شیر و امتیاز سلول های بدنی شیر در هر دو دوره از نرم افزار SAS، رویه GLM استفاده شد. در مدل مورد استفاده برای آنالیز داده ها اثر ژنوتیپ و اثر تصادفی گله، سال و فصل زایش به عنوان اثرات ثابت و روزهای باز، طول دوره شیردهی و تولید شیر به عنوان واریانس مشترک در نظر گرفته شد. آنالیز آماری اثر معنی دار ژنوتیپ را بر صفت درصد چربی شیر در هر دو دوره، پروتئین شیر در دوره دوم، ارزش اصلاحی تولید شیر، صفت تولید شیر و امتیاز سلول های بدنی در سطح احتمال 5 درصد(05/0 P) نشان داد. ولی ژنوتیپ اثر معنی داری بر ارزش اصلاحی تولید چربی شیر نشان نداد. اثر متوسط جایگزینی ایزولوسین بجای ترئونین برای رکورد تولید شیر تصحیح شده، میانگین تولید شیر روزانه، درصد چربی شیر، درصد پروتئین و امتیاز سلول های بدنی و همچنین ارزش اصلاحی تولید شیر و ارزش اصلاحی تولید چربی شیر تخمین زده شد. این نتایج نشان می داد که آلل B در افزایش تولید شیر و آلل A در افزایش چربی شیر اثر دارد. در نتیجه فراوانی بالاتر آلل B نسبت به آلل A در این پژوهش احتمالاً ناشی از روند انتخاب گاوها برای تولید شیر در سال های اخیر می باشد. نتایج این پژوهش نشان داد که چند شکلی جایگاه T4CRBR2 ژن TLR4 می تواند بیانگر پیوستگی با QTL شناسایی شده بر صفت تولید شیر روی کروموزوم 8 باشد. واژه های کلیدی: ژن TLR4، گاو هلشتاین، ژنوتیپ، چند شکلی

ارتقاء امنیت وب با وف بومی