Skip to main content
SUPERVISOR
Salar Dorafshan
سالار درافشان (استاد راهنما)
 
STUDENT
Seyed Ali Reza Alavi
سیدعلی رضا علوی

FACULTY - DEPARTMENT

دانشکده منابع طبیعی
DEGREE
Master of Science (MSc)
YEAR
1391
This study was undertaken to determine the taxonomic position of Isfahan chub using the molecular and morphological data of the fish varieties found in Zayanderud river basin in Isfahan, Iran. For the purposes of this study, 30 specimens of fish were taken from the Cheshmeh-Dimeh area using a Sein Net fishing apparatus. The sequence ofcytochrome b gene as well as the morphological characteristics for all samples were determined. Then, we used 25 morphometric attributes and 7 meristic factors to compare the relative characteristics of the samples with the holotypes of Alburnus and Petroleuciscus, using a one-sample T test.In comparing the samples with the Petroleuciscus genus , 18 factors, out of the 33 relative measurements, showed significant differences ( P 0.001); and, in comparison with the Alburnus holotype, 16 factors, out of the 26 relative measurements, showed significant difference ( P 0.001). Therefore, the results of this statistical analysis appeared to be inconclusive for the purpose of determining the taxonomical characteristics of the target species.In conducting our molecular studies, DNA were extracted from the caudal fin of fish specimens, using the phenol chloroform method, and the quality of DNA samples were evaluated using agarose gels. The PCR treatments were run at an annealing temperature of 60C using a cytochrome b gene (1142 bp) primer pair, and the relevant phylogenetic tree was drawn using the Maximum Likelihood method by using MEGA5.2 software. The resulting dendrogram placed our target species in a sister group with Alburnus fillipi and Alburnus chalcoides. The Alburnus species were determined to belong to three main clades : Clade A included A.alburnus, A.strumicae, A.hohenackeri, A.escherichii, A.scoranza, A.belvica and A.arborella species; Clade B included Alburnus sp (the samples sequenced in this study), A.filippii and A.chalcoides and Clade C included A.orontis, A.balaki, A.kotschyi and A.mossulensis . The results of this study changed the taxonomical order of this genus in such a way that the target species showed no proximity to Petroleuciscus . Interestingly, our research seemed to refute the results of previous taxonomical studies on this species based on its morphology, and appeared to confirm the presence of Alburnus species in Zayandehrud. The results of complete sequencing of c ytochrome b gene indicated that this approach may be much more suitable for taxonomical placement of local species of Iran. Furthermore, considering the usual shortcomings of morphology based methods, the approach taken in this study may prove useful for presenting a more accurate picture of the ecological diversity in aqueous ecosystems of Iran. Keywords: Cyprinidae, Systematic, Morphological characteristics, Genetic taxonomy, Cytochrome b gene
این مطالعه به منظور تعیین جایگاه آرایه شناختی عروس ماهی اصفهان با استفاده از داده های ریختی شناسی و مولکولی مربوط به ماهیان صید شده از حوضه ی رودخانه زاینده رود، طراحی شد. در مجموع 30 قطعه ماهی از منطقه ی چشمه دیمه با استفاده از تور پره صید گردید. توالی ژن سیتوکروم b و اندازه گیری های ریختی به منظور تعیین جایگاه آرایه شناختی نمونه ها مورد استفاده قرار گرفت. 25 صفت اندازشی و 7 صفت شمارشی اندازه گیری شد و از آنالیز آزمون T یک نمونه ای جهت مقایسه صفات اندازشی نسبی نمونه ها با هلوتیپ دو جنس Alburnus و Petroleuciscus استفاده شد . در مقایسه نمونه ها با جنس Petroleuciscus از بین 33 صفت اندازشی نسبی 18 صفت اختلاف معنی داری را نشان دادند )001/0 (P و در هفت صفت اختلاف معنی داری مشاهده نشد، همچنین در مقایسه با هلوتیپ جنس Alburnus از بین 26 صفت اندازشی نسبی 16 صفت دارای اختلاف معنی دار بودند )001/0 (P و شش صفت اختلاف معنی داری را نشان ندادند. این تجزیه و تحلیل آماری نتایج قابل استنادی را برای تعیین جایگاه آرایه شناختی گونه مورد مطالعه ارائه نکرد. به منظور انجام مطالعات مولکولی، استخراج DNA به روش فنول کلروفوم از باله دمی ماهی ها انجام گرفت و کیفیت DNA روی ژل آگاروز بررسی شد. واکنش زنجیره ای پلیمراز با استفاده از یک جفت آغازگر ژن سیتوکروم b (bp 1142) در دمای الحاق 60 درجه سانتی گراد انجام شد. درخت فیلوژنی بر اساس روش Maximum likelihood با استفاده از نرم افزار MEGA5.2ترسیم گردید. دندوگرام رسم شده این گونه را در گروه خواهری با دو گونه ی Alburnus filippii و Alburnus chalcoides قرار داد. نمونه های Alburnus مورد سنجش گرفته در سه خوشه اصلی قرا گرفتند: خوشه اول (A) شامل گونه های A.alburnus ، A.strumicae ، A.hohenackeri ، A.escherichii ، A.scoranza ، A.belvica و A.arborella ، خوشه دوم (B) شامل گونه های A.filippii ، A.chalcoides ، Alburnus sp. (نمونه های توالی یابی شده در این مطالعه) و خوشه سوم شامل گونه های (C) A.orontis ، A.balaki ، A.kotschyi ، A.mossulensis است. نتایج حاصل از این مطالعه جایگاه آرایه شناسی گونه مورد بررسی را تغییر داد، بطوریکه بر اساس این نتایج، گونه مزبور هیچگونه قرابتی را با جنس Petroleuciscus نشان نداد، بلکه مطالعه حاضر ضمن رد نتایج مطالعات آرایه شناسی مبتنی ریخت سنجی بر روی این گونه، وجود جنس Alburnus در حوضه زاینده رود را تأیید می کند. نتایج بدست آمده از داده های توالی یابی کامل ژن سیتوکروم b نشان می دهد که استفاده از این ژن جهت تعیین جایگاه آرایه شناسی گونه های بومی ایران بسیار مناسب است و با توجه به ضعف ها و نارسایی های معمول روش های مختلف ریخت سنجی، استفاده از این روش می تواند در ارائه شمای درست تری از تنوع زیستی در اکوسیستم های کشور یاری رسان باشد. کلمات کلیدی: کپورماهیان، سیستماتیک ، صفات ریختی، ژن سیتوکروم b ، آرایه شناسی

ارتقاء امنیت وب با وف بومی