Skip to main content
SUPERVISOR
Mohammad reza Vahabi,Mansoureh Malekian
محمدرضا وهابی (استاد راهنما) منصوره ملکیان (استاد راهنما)
 
STUDENT
Mitrasadat Fathifard
میتراسادات فتحی فرد

FACULTY - DEPARTMENT

دانشکده منابع طبیعی
DEGREE
Master of Science (MSc)
YEAR
1394

TITLE

Genetic diversity of Ferula ovina Boiss in the western rangelands of Isfahan Province
Ferula ovina Boiss is one of the most valuable forage, protective and medicinal plants that can be used for restoration of mountain ranges. F.ovina is an herbaceous perennial herb. Assessing the genetic diversity within a species plays an important role in the success of the conservation programs. Worldwide, plant gene banks play an important role in preserving vegetation and their constituent species, and ultimately protecting natural ecosystems through the collection, conservation, regeneration and replenishment of plant reproductive resources. Accordingly, if the populations of F.ovina are genetically distinct, a distinct and superior population can be introduced to restore degraded habitats. Inthis study, the genetic variation of the F. ovina was studied using an Internal Transcribed Spacer (ITS) gene by sampling five rangeland sites including Tang-e-Dozdan, Ghaleh-e-Gho, Gohar-Dare, Islamabad and Khersanak, the most important habitats in western Isfahan province. Sampling form stems and leaves of F.ovina was performed, and afterextraction of DNA, Polymerase chain reaction (PCR) was performed using a pair of N-nc18S10 and C26A primers for amplifications of the ITS region, and PCR products were sequenced. The sequences were edited and analyzed using Seqscape v.2.6 and MEGA.7 softwares. The results of genetic diversity analyses showed that the nucleotide diversity and haplotype diversity of the studied populations were low at the level of ITS gene and were 0.0006 and 0.163 respectively. Phylogenetic reconstructions of the studied populations based on Euclidean intervals indicated that there were three haplotypes in the specimens and divided in three clades. The highest genetic distance between the GO8 (from Gohar-Dare) and CH2 (from Chale-e-Gho) sample was with a value of 0.005, and in most of the samples, this distance was close to zero, indicating a genetic similarity between the samples. Generally, due to the similarity of the populations based on the ITS gene, it is recommended to use markers with higher mutation rates, such as microsatellite or AFLP, for further investigation of genetic diversity within these populations. Keywords : Mountain range, Ferula ovina , Western Isfahan province, ITS gene, Genetic variation
گیاه Ferula ovina Boiss از با ارزش‌ترین گیاهان علوفه‌ای، حفاظتی و دارویی است که می‌توان از آن در اصلاح و توسعه مراتع کوهستانی استفاده نمود؛ F. ovina ،گیاهی چند سالهعلفیاست. ارزیابی تنوع ژنتیکی درون یک گونه در موفقیت برنامه‌های حفاظت از گونه نقش مهمی دارد. بانک ژن‌های گیاهی در سراسر جهان از طریق جمع‌آوری، محافظت دائمی، احیاء و تکثیر منابع تجدید شونده گیاهی، نقش مهمی در حفظ پوشش گیاهی و گونه‌های تشکیل دهنده آن‌ها و در نهایت حفاظت اکوسیستم طبیعی دارند. براین اساس در صورتی که جمعیت‌هایموجود F. ovina از نظر ژنتیکی متمایز باشند، می‌توان جمعیت‌های متمایز و برتر را به منظور احیاء رویشگاه‌های تخریب شده و یا توسعه رویشگاه‌ها معرفی نمود. در این مطالعه تنوع ژنتیکی گونه F. ovina با نمونه برداری از پنج مکان مرتعی شامل تنگ دزدان، چاله قو، گوهر دره، اسلام‌آباد و خرسانک، که از مهمترین رویشگاه‌های F. ovina در منطقه‌ی غرب استان اصفهان هستند، با استفاده از ژنInternal Transcribed Spacer(ITS)مورد مطالعه قرار گرفت. نمونه‌بردای از ساقه و برگ‌های گیاه F. ovina انجام گرفت و پس از استخراجDNA، واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (PCR) با استفاده از یک جفتآغازگر N-nc18S10 و C26A برایتکثیر منطقه ITSانجام و محصولات PCR توالی‌یابی شدند. توالی‌های حاصل با استفاده از نرم افزار Seqscape v.2.6 و MEGA.5 ویرایش و تحلیل شدند. نتایج حاصل از بررسی تنوع ژنتیکی نشان داد که تنوع نوکلئوتیدی و تنوع هاپلوتایپیجمعیت‌های مورد مطالعه در سطح ژن ITS اندک و به ترتیب میزان ????/? و ???/? بود. ترسیم روابط فیلوژنتیکی جمعیت‌های مورد مطالعه در غرب اصفهان بر اساس فواصل اقلیدسی بین میانگین جمعیت‌های گونه F. ovina نشان دهنده وجود سه هاپلوتیپ در نمونه‌ها و قرار گیری آ‌ن‌ها در سه شاخه بود. بیشترین فاصله ژنتیکی در بین نمونهGO8(از گوهر دره) و CH2(از چاله‌قو) با مقدار ???/? بوده و در بین اکثر نمونه‌ها این فاصله برابر صفر بود که مشابهت ژنتیکی بالای نمونه‌ها را نشان می‌دهد.به طور کلی با توجه به تشابه زیاد جمعیت‌های مورد مطالعه در سطح ژن ITS پیشنهاد می‌گردد که از نشانگرهایی که نرخ جهش بالایی دارند نظیر ریز ماهواره یا AFLP برای بررسی تنوع ژنتیکی F. ovina استفاده شود. کلمات کلیدی: مرتع، گونه Ferula ovina ، غرب اصفهان، ژن ITS، تنوع ژنتیکی.

ارتقاء امنیت وب با وف بومی