Skip to main content
SUPERVISOR
Majid Talebi,Bahram Sharifnabi
مجید طالبی (استاد راهنما) بهرام شریف نبی (استاد مشاور)
 
STUDENT
Fariborz Ansari
فریبرز انصاری خاریکی

FACULTY - DEPARTMENT

دانشکده کشاورزی
DEGREE
Master of Science (MSc)
YEAR
1393

TITLE

Detection of Disease Resistance Gene Analogues (RGAs) in Iranian Apple and Pear Genotypes
Use ofresistancecultivars is one of the major approaches to reduce crop damages caused by biotic stresses. Development of such cultivars requires identification, isolation and mapping ofresistance genes. Plants utilize a variety of strategies to withstand attack by the huge assortment of pathogens found in their habitats. The existence of resistance genes (R-genes) that are able to detect the presence of specific pathogen races by recognizing ligands encoded by the so-called avirulence genes (Avr) of pathogens is one of the most effective and predominant strategies. The nucleotide sequence of the cloned resistance genes from plants indicate that there is conserved regions in these genes is called resistance gene analogues (RGAs). Degenerate primers were designed based on the sequences of RGA and were used in study of resistance mechanism. Among these, the -LRR Keywords : apple, pear, RGA, resistance genes, -LRR
تولید و استفاده از ارقام مقاوم یکی از راه‌کارهای اصلی و عملی کنترل بیماری‌ها در گیاهان زراعی و کاهش خسارت ناشی از آن‌ها است. لازمه چنین عملی، شناسایی، مکان‌یابی و جداسازی ژن‌های مقاومت به بیماری، جهت استفاده از آن‌ها در برنامه‌های اصلاحی است.گیاهان از روش‌های مختلفی برای مقابله با حمله مجموعه عظیمی از پاتوژن‌های موجود در زیستگاه خود استفاده می‌کنند. وجود ژن‌های مقاومت (R-genes) که قادر به تشخیص حضور نژادهای خاصی از پاتوژن است از مؤثرترین و غالب‌ترین استراتژی‌ها است. مقایسه ترادف نوکلئوتیدی ژن‌های مقاومت همسانه سازی شده از گیاهان مبین وجود نواحی حفاظت‌شده‌ای به نام آنالوگ‌های ژن مقاومت (RGA) در این ژن‌ها هست. بر اساس ترادف های RGA، آغازگرهای هم‌ارز طراحی گردیده و در بررسی مکانیسم مقاومت به‌کاربرده شدند. در این میان کلاس _LRR، رایج‌ترین کلاس ژن‌های مقاومت هستند، که بیشتر پروتئین‌های رمز شده توسط ژن‌های مقاومت دارای یک محل اتصال به نوکلئوتید () هستند که به یک تکرار غنی از لوسین (LRR) با طول متغیر در انتهای کربوکسیل متصل است. این دامنه در برهمکنش‌های پروتئین-پروتئین و ترارسانی پیام‌های مولکولی شرکت می‌کند. تنها نقش ثابت‌شده برای ژن‌های رمزکننده پروتئین‌های دارای _LRR در گیاهان،مقاومت به بیماری‌ها و آفات بوده است. در این مطالعه با استفاده از دو جفت آغازگر هم ارز طراحی شده براساس دامنه -LRR توالی های RGA موجود در شش ژنوتیپ سیب وحشی و چهار ژنوتیپ گلابی وحشی از منطقه استان مازندران و چاچرانه استان اصفهان تکثیر و همسانه سازی شد. توالی های نوکلئوتیدی RGA های به دست آمده با استفاده از BLAST با توالی های موجود در بانک داده NCBI هم ردیف سازی شدند و با دارا بودن تشابه بالا با RGAهای موجود در بانک داده مورد تایید قرار گرفتند. ترسیم درخت فیلوژنتیکی براساس توالی پروتئینی RGAهای سیب با آغازگرهای OLE و BP2 و آغازگر OLE برای گلابی بیان کرد که ژنوتیپ های یک منطقه دارای تنوع کمتری نسبت به هم در یک گروه قرار گرفتند. هم ردیف سازی توالی پروتئینی RGAهای سیب و گلابی وحشی با چهار RGA شناخته شده بااستفاده از ClustalW و ترسیم درخت فیلوژنتیکی نشان داد که این RGAهای شناسایی شده دارای تطابق حدود %21 تا %42 هستند و دارای دامنه های محافظت شده می باشند. این مطالعه نشان داد که آنالوگ ژن های مقاومت در گونه های وحشی سیب و گلابی ایران به خوبی قابل ردیابی هستند و با وجود درصد تشابه بالا در یک منطقه جغرافیایی، دارای تنوع می باشند و ازآن جاکه ژنوتیپ های وحشی دارای یک سری مقاومت های ذاتی نسبت به بعضی بیماری ها می باشند، می توان از آن hyhy;ها برای اهداف اصلاحی استفاده نمود. واژه‌های کلیدی : سیب، گلابی، RGA، ژن های مقاومت، -LRR

ارتقاء امنیت وب با وف بومی