Skip to main content
SUPERVISOR
Ali Ahoonmanesh,Amir Massah
علی اهون منش (استاد راهنما) امیر مساح (استاد راهنما)
 
STUDENT
Seyed Roohollah Omrani
سیدروح اله عمرانی

FACULTY - DEPARTMENT

دانشکده کشاورزی
DEGREE
Master of Science (MSc)
YEAR
1384

TITLE

Determination of Certain Molecular and Biological Properties of Cucurbit Aphid-Borne Yellows Virus in Isfahan and Hormozgan Provinces
Cucurbit aphid-borne yellows virus (CABYV) was reported for the first time as a tentative new member of Luteovirus group and one of the most prevalent viruses infecting cucurbits in France . This virus causes yellowing and thickening of the older leaves in infected plants. In this study, cucurbits including cucumber ( Cucumis sativus L.), Melon ( Cucumis melo L.), Squash ( Cucurbita sp.), Watermelon ( Citrullus lanatus L.) and weeds showing yellowing and thickening of the older leaves and symptomless samples were collected from cucurbit fields in Isfahan and Hormozgan provinces. Total RNA of leave samples was extracted and used as template in RT-PCR. RT-PCR was preformed using CABYV specific primers (CABYVGF and CABYVGR). Expected size amplification of 484 bp in some samples of squash, cucumber, and melon and weed species of Chenopodium album , Plantago major and Sinapsis arvensis confirmed their infection to CABYV. For amplification of full length of CABYV coat protein (CP) gene, two overlapping expected sizes of 484 bp (amplified using CABYVGR and CABYVGF primers) and 479 bp (amplified using CABYVBR and CABYVBF primers) were amplified in two isolates named Agha-Ali-Abbas and Rudan. The PCR products were cloned and sequenced. The BLAST search showed high similarity between nucleotide sequences of Agha-Ali-Abbas and Rudan isolates and other CABYV isolates available at GenBank. Two overlapped sequences were assembled to construct full length of CP gene. Comparison of deduced amino acid sequences of CP gene of Agha-Ali-Abbas and Rudan isolates with those of other CABYV isolates revealed the highest (98.4% and 98.9%) and the lowest (90.2% and 90.7%) similarity with pM0911-2 and 37-5 isolates of CABYV, respectively. These results were confirmed by phylogenetic analysis based on amino acid sequence of CP gene. In transmission test, Aphis gossypii transmitted CABYV to Cucumber. The infection of Cucumber plants was confirmed by RT-PCR
ویروس زردی شته زاد کدوئیان (CABYV) Cucurbit aphid-borne yellows virus برای اولین بار به عنوان یک عضو جدید از گروه لوتئوویروس ها و یکی از متداول ترین ویروس های آلوده کننده کدوییان در فرانسه گزارش شد. این ویروس باعث ایجاد زردی و ضخیم شدگی در برگ های پیر گیاهان آلوده می شود. در این تحقیق از گیاهان خانواده کدوئیان شامل خیار (‍ Cucumis sativus L.)، خربزه ( ‍ Cucumis melo L.)، کدو ( Cucurbita sp.) و هندوانه ( ‍ Citrullus lanatus ) و علف های هرز دارای علائم زردی و ضخیم شدگی برگ های پایینی و مسن گیاه ونمونه های بدون علائم از مزارع کدوئیان استان های اصفهان و هرمزگان نمونه برداری شد. از نمونه های برگی، RNA کل استخراج و به عنوان الگو در آزمون RT-PCR استفاده شد. آزمون RT-PCR با استفاده از آغازگر های اختصاصی CABYV ( CABYVGFو CABYVGR) انجام شد. تکثیرقطعه مورد انتظار bp 484 در بعضی از نمونه های کدو، خیار، و خربزه و علف های هرز Chenopodium album ، Plantago major و Sinapsis arvensis آلودگی آن ها به CABYV را تایید کرد. برای تکثیر ژن پروتئین پوششی (CP) ویروس، دو قطعه همپوشان مورد انتظار با اندازه هایbp 484 (با استفاده از آغازگرهای اختصاصی CABYVGFو CABYVGR) وbp 479 (با استفاده از آغازگرهای اختصاصی CABYVBFو CABYCBR)در دو جدایه آقا علی عباس و رودان تکثیر شدند. محصولات PCR این دو جدایه همسانه سازی و توالی یابی شدند. مقایسه با استفاده از ابزار جستجوی BLAST تشابه بالای توالی های نوکلئوتیدی جدایه های آقا علی عباس و رودان را با دیگر جدایه های CABYV موجود در بانک ژن نشان داد. برای به دست آوردن توالی ژن CP، دو توالی همپوشان تکثیر شده در جدایه های آقا علی عباس و رودان مونتاژ شدند. مقایسه توالی های آمینواسیدی ژن CP جدایه های آقا علی عباس و رودان با دیگر جدایه های CABYV بیشترین درصد تشابه را با جدایه M 0911-2از چین به ترتیب به میزان 4/98 و 9/98 و کمترین تشابه را با جدایه 37-5 از اسپانیا به ترتیب به میزان 2/90% و 7/90% نشان دادند. این نتایج توسط رسم درخت تبارزایی بر اساس توالی آمینواسیدی ژن CP تایید شد. در آزمون انتقال، شته Aphis gossypii این ویروس را به خیار انتقال داد. آلودگی گیاهان خیار با استفاده از آزمون RT-PCR تایید شد.

ارتقاء امنیت وب با وف بومی