Skip to main content
SUPERVISOR
Hossein Farrokhpour,Abdol-Hossein Dabbagh
حسین فرخ پور (استاد مشاور) عبدالحسین دباغ (استاد راهنما)
 
STUDENT
Samaneh Ahmadi teshnizi
سمانه احمدی تشنیزی

FACULTY - DEPARTMENT

دانشکده شیمی
DEGREE
Doctor of Philosophy (PhD)
YEAR
1393

TITLE

Preparation of cystine-based fluorescent and colorimetric sensors and the effect of diverse ions in the stability of cystine-based cyclopeptide by quantum chemical calculation
In the second section of this thesis, a theoretical study on the stability of new cystine-based tricyclopeptide (TCP) stereoisomers in achiral media in the presence of Li + , Na + , K + , F ? , Cl ? , and Br ? ions was performed at the M06-2X/6-311++G(d,p) level of theory in both gas and aqueous phases. The nature of the intermolecular interaction between TCPs and ions were studied by natural bond orbital analysis (NBO) and the quantum theory of atoms in molecules (QTAIM) methods in gas phase. According to the size of the ions and configuration of TCPs, the location of ions (within or above the TCPs) and the types of formed intermolecular interactions are different. The results revealed that the free TCP7 and TCP8 enantiomers in gas phase and also TCP1 and TCP2 enantiomers in aqueous phase are the most stable structures among all TCPs. Moreover, the calculated energies of the optimized complexes containing the same ion show different stability order as compared to the free TCPs.
در سال های اخیر، استفاده از مولکول هایکوچک با توجه به ویژگی های ساختاری و نوری شان جهت شناسایی و تشخیص یون های زیستمعدنی بسیار مورد توجه پژوهشگران قرار گرفته است. حسگر های آمفی یونوفور (Amphi-ionophore) از جمله مولکول هاییهستند که از اهمیت ویژه ای برخوردارند؛ زیرا قابلیت شناسایی گونه های کاتیونی وآنیونی را دارند از جمله اینحسگر ها به ترکیب های آمیدی می توان اشاره نمود.در رساله حاضر بهطراحی، سنتز و شناسایی و کاربرد مولکول هایی آمیدی زیست سازگار برای تشخیص یونبیومعدنی آهن و آنیون سمی سیانید، شناسایی کمپلکس های آن پرداخته شده است.در بخش های اول و دوم، با توجه به نقشکلیدی یون های Fe 3+ و CN - در سیستم های زیستی، به تشخیص و اندازه گیری این یون های مهم به روشی سادهپرداخته شد. به منظور این شناسایی، دو مولکول آلی کایرال به نام های Cys(cou) 2 و Cys(imid) 2 بر پایه سیستین طراحی و سنتزشدندکه به طور گزینشی به ترتیب از طریق مکانیسم خاموش و روشن شدن نشر فلورسانس درحضور این یون ها رفتار می کنند. این حسگر های مولد نشر در یک سنتز تک مرحله ای طیواکنش آبگیری بین اسید (کومارین-3-کربوکسیلیک اسید و یا مشتق ایمید اسید) و آمین ( L -سیستین دی متیل استر دی هیدروکلرید) تهیه شدند. افزون بر این، حسگرCys(cou) 2 به عنوان حسگر شیمیایی نوری برایتشخیص کاتیون Fe 3+ و آنیون CN - در حلال DMSO:H 2 O با نسبت (1:1، 4/7 = pH، بافر تریس) و حسگر Cys(imid) 2 نیز حسگری نوری برای تشخیص Fe 3+ در حلال DMSO حساسیت و گزینش پذیری بسیاربالایی را نشان می دهند.و اما با توجه به این کهپپتید های حلقوی دسته بزرگی از ترکیبات طبیعی هستند که از نظر آمفی یونوفور بودن بسیارمورد توجه قرار گرفته اند؛ در بخش سوم این رساله، به بررسی مطالعات نظری اینترکیب ها به عنوان مولکول های آمفی یونوفور پرداخته شده است. مطالعات تئوری بر روی پایداری استرئوایزومر پپتید های سه حلقه ای جدید بر پایهسیستین (TCP) در محیطی غیرکایرال (در حضور آنیون ها و کاتیون های مختلف: Li + ، Na + ، K + ، F - ، - Cl و - Br) درسطح تئوری M06-2X/ 6-311++G(d,p) در دوفاز گازی و محلول در آب انجام شد. در ادامه پس از بهینه سازی ساختار استرئوایزومر ها و کمپلکس ها در سطح تئوریمذکور، انرژی پیوند به وسیله محاسبات خطای انطباق مجموعه پایه (E) وانرژی نقطه صفر (ZPE) تصحیح گردید. و نهایتاً به منظوربررسی ماهیت برهمکنش بین مولکولی بین TCP و یون ها از آنالیز های اوربیتال طبیعیپیوندی (NBO) و محاسبات تئوری کوانتومی اتم ها در مولکول (QTAIM) استفاده شد.

ارتقاء امنیت وب با وف بومی