این پژوهش با هدف بررسی جنبه های پایه به نژادی در فسکیوی بلند با بهره گیری از روشهای کلاسیک و مولکولی در قالب 5 مطالعه مجزا ولی منسجم طی سالهای 1381 تا 1386 به اجرا درآمد. در مطالعه اول تنوع ژنتیکی بین و درون 46 اکوتیپ داخلی و خارجی (حدود 1000 ژنوتیپ) طی دو سال مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج حاکی از اختلاف بسیار معنی دار بین نمونه ها و تنوع ژنتیکی بالا بین و درون ژرم پلاسم مورد مطالعه بود. نمونه های داخلی از برتری نسبی قابل توجهی بر نمونه های خارجی برخوردار بودند. همبستگی عملکرد علوفه خشک با صفات فنولوژیک منفی و با درصد ماده خشک, ارتفاع بوته, تعداد ساقه, قطر یقه (طوقه), رشد بهاره, طول برگ, توان استقرار و دیرزیستی مثبت بود ولی عملکرد علوفه با عرض برگ و حساسیت به زنگ رابطه معنی داری نداشت. صفات قطر یقه, توان استقرار, درصد ماده خشک, ارتفاع و تعداد ساقه بارور به عنوان مهمترین اجزای عملکرد علوفه شناخته شدند. گروهبندی اکوتیپ ها به خوبی اکوتیپ های داخلی و خارجی را از یکدیگر متمایز کرد و در بسیاری از موارد نیز نمونه های دارای منطقه یا منشاء اقلیمی مشابه را از یکدیگر تفکیک نمود. در مطالعه دوم با استفاده از 12 ترکیب آغازگریAFLP, روابط فیلوژنی وتنوع ژنتیکی 38 نمونه (25 نمونه فسکیوی بلند و 13 نمونه از 5 گونه خویشاوند) مورد بررسی قرار گرفت. نتایج حاصل از360 نشانگرچندشکل نشان دادکه فسکیوهای برگ پهن (فستوکا آروندیناسه و پراتنسیس) شباهت ژنومی بیشتری با گونه های جنس لولیوم در مقایسه با فسکیوهای برگ نازک (فستوکا روبرا و اوینا) دارند همچنین فسکیوی بلندحداکثر شباهت را با فسکیوی مرتعی داشت که نتایج مطالعه روی DNAی ریبوزومی را تایید می کند. نتایجAFLP حاکی از تنوع کمتر درون جوامع خارجی و تنوع بیشتر درون جوامع داخلی بود. نمودار خوشه ای UPGMA و تجزیه مولفه های اصلی اکوتیپ های فسکیوی بلند را به شش گروه تفکیک کرد که تا حدود زیادی با منشاء جغرافیایی و برخی خصوصیات نمونه ها تطابق داشت. در مطالعه سوم تعداد 25 ژنوتیپ برتر بر اساس مطالعه اول گزینش و به صورت کلونی طی دو سال مورد ارزیابی فنوتیپی و مولکولی, با استفاده از 50 آغازگر EST-SSR, قرارگرفتند. نتایج تجزیه و تحلیل کلونی نشان داد به رغم اعمال شدت گزینش بالا (از بین حدود یک هزار ژنوتیپ) هنوز فاصله ژنتیکی زیادی بین ژنوتیپ ها وجود دارد. از 229 آلل تولید شده توسط 50 مکان ژنی SSR-EST تعداد 175 آلل چندشکلی نشان دادند.گروه بندی بر اساس این نشانگرها, 25 ژنوتیپ را در7 گروه مجزا, طبقه بندی نمود که با اطلاعات منشاءگزینش ژنوتیپ ها تناسب داشت. تطابق کلی نیز بین گروه بندی بر اساس خصوصیات فنوتیپی با گروهبندی EST-SSR مشاهده گردید. بر اساس میانگین و دامنه شاخص تشابه ژنتیکی بر مبنای ارزیابی فنوتیپی و مولکولی, ژنوتیپ های مناسب برای تشکیل جوامع نقشه یابی یا ایجاد واریته ترکیبی معرفی وگروه های هتروتیک به منظور بررسی نقش تنوع ژنتیکی بر نمود نتاج (بخش بعد) شناسایی شدند. در مطالعه چهارم به منظور برآورد GCA جهت تعیین والدین مناسب و مقایسه میزان انطباق آن با نتایج ارزیابی های کلونی و مولکولی, فامیل های ناتنی حاصل از پلی کراس25 ژنوتیپ گزینش شده قبلی, طی دو سال مورد بررسی قرارگرفتند. نتایج قابلیت ترکیب پذیری عمومی